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#공간전사체  #뇌 진화   #NGS   #RNA   #Streo-seq   #양막류

 양막류(Amniote)의 종뇌는 정교하고 복잡하게 발전해왔으나, 그 유전학적 정체성과 진화에 대한 이해는 여전히 불충분합니다. 최신 기술인 Stereo-seq은 공간 전사체 아틀라스 구축이 가능한 기술력을 제공하여 파충류, 조류, 양서류, 포유류 등 다양한 종의 종뇌의 공간적 지도를 완성했으며, 종 간 종뇌의 아틀라스 비교를 통해 석형류의 DVR(등쪽 뇌실 능선)과 포유류의 신피질 사이의 진화 관계를 해독할 수 있게 하였습니다. 이를 통해 종뇌의 진화와 관련된 두 종류의 유전자 조절 모델, 즉 전사 인자(TF)와 이펙터 유전자 사이의 보존된 조절 관계를 특징으로 하는 '결합 모델(coupled model)'과 이 조절 관계가 종에 따라 달라지는 '이동 모델(shift model)'을 발견하였습니다. 특히 조류 DVR과 포유류 신피질의 기능 수렴 진화에 대한 분자적 메커니즘을 밝혀냄으로써, 서로 다른 전사 인자를 통해 동일한 이펙터 유전자를 모집함을 시사하고 종에 따른 종뇌의 진화 관계를 밝혀냈습니다.  Stereo-seq의 다양한 칩 크기와 단일 세포 수준의 해상도는 뇌의 진화에 대한 근본적인 이해를 제공하고 새로운 모델을 발견하는 데 유용한 기술을 제공하였습니다.  
 이 웨비나에서는 최신 Stereo-seq 기술로 다양한 양막류의 뇌 아틀라스를 비교 분석하여 피질 진화의 유전학적 메커니즘을 밝히며, DVR과 신피질 간의 진화 관계를 해독하고, 종간 차이를 이해하는 데 중요한 정보를 제공합니다.

Agenda :

  • 1. 단일 세포 공간 전사체 분석 솔루션(Stereo-seq) 소개
  • 2. Stereo-seq을 이용한 양서류 Brain Atlas 의 분석
  • 3. 양막의 대뇌피질 진화에 대한 이해 구축
  • 4. 단일 세포 다중 오믹스 분석의 도전과 기회

 

일시 : 2024년 6월 20일 (목) 오전 10시 30분 ~ 11시 30분 (KST)

 

연자

Shiping Liu, PhD
Senior research professor

BGI reserch

Shiping Liu Profile >


Publication

Single-Cell Stereo-seq reveals Induced progenitor cells involved in Axolotl brain regeneration

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